巴拿马国旗呈横长方形，长与宽之比为3：2。由四个长方形组成。旗地为白、红、蓝三色。靠旗杆上方为白色，白色中央绘有一颗蓝色五角星；下方为蓝色。旗的右边上方为红色，下方为白色，这白色中央绘的是一颗红色五角星。白色象征和平，红色代表原巴拿马的自由党，蓝色代表原巴拿马的保守党。红、蓝两色在国旗上的位置表示自由党和保守党联合起来为民族的利益而奋斗。旗地上的蓝、红两颗五角星分别象征人们的忠诚和力量。1903年11月3日巴拿马共和国成立时升起的就是这面国旗。